Celem Instytutu jest obrona zasad chrześcijańskich w życiu społecznym. Propagujemy i bronimy wartości związanych z rodziną, tradycją i własnością. Od początku naszej działalności naszym hasłem jest „Przebudźmy sumienia Polaków”.
Instytut im. Ks. Piotra Skargi razem z organizacjami katolików świeckich z Francji, Włoch, Portugalii, Austrii, Niemiec i Hiszpanii powołał Federację Pro Europa Christiana z siedzibą w Strasburgu, w celu promocji chrześcijańskich wartości i zasad moralnych.